但是宦官却有着它的特殊性，太祖虽然立下了太监不得干政的律法，但成祖以后，太监的权势就越来越盛。到后期已经发展成了一个隐性的制度！比如冯保，在来历不明的隆庆遗诏中就是和高拱张居正等人并列的顾命大臣！

当然，太监的权力很大程度上皇帝，说白了还是皇帝的爪牙。这一次，要不是因为太后，要不是为了加强自己的威势和拉拢文官，自己绝对不会费这么多心思来对付一个冯保。

又令御前侍卫唐郎为羽林卫统领，负责皇城警卫。

十七日，内阁张四维，吏部尚书张瀚，兵部尚书王崇古等二十八人请辞。次日，万历亲笔批准。由王国光升任吏部尚书，张学颜接替殷正茂为户部尚书；礼部尚书马自强不变动；方逢时出任兵部尚书，王崇古调任为致德公学教谕；严清担任刑部尚书；李幼孜继任为工部尚书。都察院方面，陈价取代陈炌为左都御史。

四月十六日，万历帝在皇极殿召开早朝，宣布冯保谋逆，着抄家，发配凤阳守灵，不久赐死；其余阉党充军流放劳役不等。

宦官可以说是沈觉非最厌恶的东西之一了。宫刑摧残人性，已经让沈觉非不忍。而这些太监又往往不法，仗势欺人，民愤极大，明代的灭亡太监也少不了关系。这一次，借着冯保事件，沈觉非决定先拔了宦官的爪牙，然后消灭宦官这个历史产物，根绝宦官干政的可能。

但是沈觉非也有顾虑，他对文官结党作意气之争的坏毛病很了解。党争是个可怕的字眼，北宋末年和晚明就是在党争中消耗了自己，败坏士风，颓废人心，最后彻底沦亡于异族的。人性贪婪，文官们中高道德的毕竟是少数，更多是有血有欲的普通人，面对权力的诱惑是难以抵挡的。为了权力，他们极有可能投机钻营，结成一党，相互勾结，蛇鼠一窝，党同伐异，为反对而反对，置国家大事于不顾。连历史上著名的东林党中的一些人都有这样的毛病，何况其它！

这决不是后世的政党制度，而是政治清明的天敌！这当然不是沈觉非愿意看到的结果。

现在有了冯保的原因，就可以名正言顺的废掉东厂，将司礼监置于内务大臣之下，让太监没有作威作福的可能，割去帝国身上的一个毒瘤。

十九日早朝，诏令：“废除东厂。锦衣卫的镇抚司也一并废除。从此，锦衣卫只有监察权，没有独立司法权。全国刑政通归刑部﹑都察院和大理寺处理。同时设立总理内务大臣一员，管理皇家事务，大小太监宫女皆受节制，正三品衔，由陈于陛出任。”

这一道诏书发下，立即受到了京师大小官员们欢迎。宦官之祸，由来已久矣！不想今日一诏废之，没有了东厂和锦衣卫镇抚司，看那些太监还如何横行。心喜若狂的文官们白日纵酒，“弹冠相庆”，纵酒吟诗，歌功颂德，一日之间沈觉非的声望爆涨。二十日早间通政司衙门就接到了百余本颂圣的折子。

但是如何安排这些太监却又是一个问题了。

现在宫中宦官是一个庞大的群体，紫禁城中有多少太监，连沈觉非这个皇帝也不清楚，不可能马上都裁撤掉，一来怕引起祸乱，二来放他们出宫，其中大部分人生计堪忧，因此只得缓慢裁减。

沈觉非给新任内务大臣陈于陛交代了一点：不再接受新太监，也禁止民间私自阉割求进。然后逐渐合并太监机构，减少人数。至于后宫中服务人员，一来往后宫中也用不了那么多人，二来沈觉非计划用女官来取代宦官。让陈于陛挑选一些品行优良，识文断字的宫女担任女官，参与管理，等到宦官们基本淘汰完时，这些女官就可以接任了。

欲速则不达。沈觉非在估量了风险后，决定搁置原意，折中处理，一步一步地来吧。将兵部尚书和户部尚书调入内阁，让内阁中有通晓财政和军事的人才，这样内阁决策也科学一些，并且逐渐形成这两部尚书照例进入内阁的惯例。

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同日，潞王进学，不久搬离皇宫，出居其在京师的藩邸。

二十八日，锦衣卫镇抚司正式撤销，监狱中的犯人大半释放，其余移交刑部，关押半年的燕老爹才得已还家。而东厂监狱中的重要人犯王大臣，经过刑部官员审讯，证明其行刺圣上乃是冯保诬陷，身上搜出刀剑也是冯保栽赃。最后以冲撞御驾的过失发配到东北，后不知所踪。

二十日，吕调阳病重，请求致仕，诏准。如此，内阁就是张居正，申时行，王国光，张学颜，马自强五人，看来是一个不错的班子，沈觉非自己也觉得满意。最重要的是这个班子是自己安排的，而不是听从张居正的意见。

二十二日，上两宫太后徽号，由两个字改成四个字。

万历六年的政变还没开始就结束了。

二十三日赏赐功臣，从陈于陛，唐郎，戚继光，李谪凡等四十多人各有恩赐。内监安宁赐银三千两，赐穿飞鱼服。

二十六日，由礼部尚书马自强和内务大臣陈于陛策封王芸为恭妃，这也是万历帝沈觉非的第一位妃子。

二十七日，沈觉非光临外祖武清侯李伟家，宾主尽欢。沈觉非于酒筵上任命李遥的义子李光为羽林卫副统领，协助唐郎掌握负责宫廷安全。

同一天，命令户部尚书张学颜﹑礼部尚书马自强﹑兵部尚书方逢时三人为内阁学士，进入内阁。本来明朝内阁成员有由朝廷大臣廷推的习惯，但现在大乱之后，官员们还没有完全反应过来，对沈觉非的安排也就没有提出异议。

沈觉非一直想在法理上确立内阁国家行政中枢的地位，恢复历史上“皇帝与丞相”共同治理国家的模式，给内阁更大的权力，逐渐建立类似后世君主立宪的政治体制。毕竟一群精英群策群力要比一个皇帝更能有效地治理国家，历史上明代的内阁在这方面迈出了第一步。明朝中后期内阁权力大增，因此尽管皇帝不勤政，但是国家照常运转，没有出现大的问题。而满清继承了明朝的皇帝独裁，又抛弃了内阁。皇帝一切正确，万事独揽，虽然一个个都勤政不已，但是效果却是糟糕不已。